Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms