Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms