Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms