Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX1P40424 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX1P40424 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX1P40424 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX1P40424 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX1P40424 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX1P40424 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX1P40424 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX1P40424 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms