Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms