Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6P35125 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6P35125 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6P35125 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6P35125 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6P35125 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP6P35125 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP6P35125 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP6P35125 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP6P35125 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6P35125 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms