Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTF4P34130 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTF4P34130 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTF4P34130 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NTF4P34130 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTF4P34130 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTF4P34130 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTF4P34130 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms