Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms