Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms