Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms