Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1P29120 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK1P29120 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms