Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB2P29033 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB2P29033 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB2P29033 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms