Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK3P27448 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK3P27448 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK3P27448 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK3P27448 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK3P27448 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms