Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms