Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRGP23470 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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