Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPREP23469 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPREP23469 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPREP23469 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPREP23469 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms