Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms