Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRAP18433 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms