Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms