Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms