Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPCAMP16422 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPCAMP16422 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPCAMP16422 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms