Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms