Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCP1P13796 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCP1P13796 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCP1P13796 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCP1P13796 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCP1P13796 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCP1P13796 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCP1P13796 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCP1P13796 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms