Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG2P13521 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG2P13521 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG2P13521 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms