Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA4P12838 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms