Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP3P12645 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP3P12645 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP3P12645 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms