Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNAT1P11488 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNAT1P11488 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms