Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARBP10826 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RARBP10826 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARBP10826 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARBP10826 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARBP10826 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARBP10826 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARBP10826 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms