Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALM3P0DP25 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms