Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms