Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms