Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L8P0C7I0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L8P0C7I0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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