Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM3P06753 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM3P06753 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM3P06753 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM3P06753 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM3P06753 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms