Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFPP02771 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFPP02771 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFPP02771 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFPP02771 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFPP02771 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFPP02771 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFPP02771 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms