Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL1O95922 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL1O95922 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL1O95922 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL1O95922 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL1O95922 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL1O95922 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms