Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB6O95452 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB6O95452 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB6O95452 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB6O95452 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB6O95452 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB6O95452 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB6O95452 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms