Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC2O95347 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC2O95347 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC2O95347 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC2O95347 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC2O95347 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC2O95347 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC2O95347 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC2O95347 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC2O95347 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC2O95347 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms