Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN1O94985 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms