Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms