Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNT1O60563 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNT1O60563 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms