Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH6O60337 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH6O60337 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH6O60337 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH6O60337 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH6O60337 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH6O60337 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms