Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTRA2O43464 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms