Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMINO43313 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMINO43313 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMINO43313 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMINO43313 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMINO43313 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMINO43313 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATMINO43313 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATMINO43313 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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