Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VGFO15240 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VGFO15240 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
VGFO15240 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VGFO15240 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VGFO15240 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VGFO15240 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VGFO15240 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VGFO15240 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VGFO15240 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VGFO15240 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VGFO15240 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VGFO15240 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VGFO15240 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VGFO15240 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
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