Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms