Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP1O00294 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP1O00294 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP1O00294 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP1O00294 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP1O00294 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP1O00294 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms