Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHLA1C9JL84 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms