Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVV-2B6SEH9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms