Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRIQ3A6PVS8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms