Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBY3A6NI87 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms